Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb3D3Z6J4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms