Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Hfm1D3Z4R1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hfm1D3Z4R1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hfm1D3Z4R1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hfm1D3Z4R1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hfm1D3Z4R1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Hfm1D3Z4R1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hfm1D3Z4R1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hfm1D3Z4R1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms