Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms