Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
1700015F17RikD3YUK8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700015F17RikD3YUK8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms