Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrc5C3VPR6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrc5C3VPR6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms