Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmf1B9EKI3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmf1B9EKI3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmf1B9EKI3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms