Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Cttnbp2B9EJA2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Cttnbp2B9EJA2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms