Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppfia1B2RXQ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppfia1B2RXQ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppfia1B2RXQ2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms