Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah3B2RWG3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Siah3B2RWG3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Siah3B2RWG3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms