Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hbb-bh2B2RVB7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 518.2 ms