Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rd3lB2RV38 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rd3lB2RV38 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms