Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Abcc8B2RUS7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Abcc8B2RUS7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Abcc8B2RUS7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Abcc8B2RUS7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Abcc8B2RUS7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms