Protein–RNA interactions for Protein: B2KGE5

Fam229a, Protein FAM229A, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam229aB2KGE5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam229aB2KGE5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam229aB2KGE5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms