Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AU022751B1B0V2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AU022751B1B0V2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
AU022751B1B0V2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms