Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trabd2bB1ATG9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trabd2bB1ATG9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms