Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm438B1ASB3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm438B1ASB3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms