Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prr29B1ARI9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prr29B1ARI9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prr29B1ARI9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms