Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap221A9Q751 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cfap221A9Q751 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap221A9Q751 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap221A9Q751 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap221A9Q751 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap221A9Q751 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap221A9Q751 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap221A9Q751 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap221A9Q751 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap221A9Q751 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cfap221A9Q751 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap221A9Q751 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cfap221A9Q751 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms