Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skor2A7M7C7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Skor2A7M7C7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Skor2A7M7C7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Skor2A7M7C7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms