Protein–RNA interactions for Protein: A6H584

Col6a5, Collagen alpha-5(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a5A6H584 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col6a5A6H584 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a5A6H584 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a5A6H584 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col6a5A6H584 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col6a5A6H584 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Col6a5A6H584 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a5A6H584 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a5A6H584 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col6a5A6H584 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms