Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Odf2A3KGV1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Odf2A3KGV1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms