Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trmt1lA2RSY6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trmt1lA2RSY6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms