Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Samt1A2BED8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Samt1A2BED8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms