Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Upf2A2AT37 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Upf2A2AT37 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf2A2AT37 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms