Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syndig1A2ANU3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syndig1A2ANU3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms