Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zkscan16A2ALW2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zkscan16A2ALW2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zkscan16A2ALW2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms