Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VirmaA2AIV2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VirmaA2AIV2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VirmaA2AIV2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms