Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Brwd3A2AHJ4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Brwd3A2AHJ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Brwd3A2AHJ4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Brwd3A2AHJ4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms