Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd4A2AFR3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd4A2AFR3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd4A2AFR3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms