Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2dnl2A2AFH2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube2dnl2A2AFH2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms