Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Myom3A2ABU4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Myom3A2ABU4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Myom3A2ABU4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms