Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms