Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms