Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms