Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trbv2A0A0B4J1G8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trbv2A0A0B4J1G8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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