Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ispd-203ENSMUST00000221177 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5624-204ENSMUST00000227882 842 ntAPPRIS P5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp982-202ENSMUST00000105721 1488 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gtpbp6Q3U6U5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms