Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Cd22-210ENSMUST00000189718 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Phc1-202ENSMUST00000081849 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Mpp1-201ENSMUST00000033775 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Glul-201ENSMUST00000086199 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Hacl1-201ENSMUST00000022437 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Hacl1-214ENSMUST00000167175 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Eif2d-201ENSMUST00000068791 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Btg4-201ENSMUST00000114431 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Slc2a9-202ENSMUST00000067872 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Vpreb1P13372 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Sez6l2-203ENSMUST00000106335 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Pcdh1-201ENSMUST00000057185 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Plekhb2-203ENSMUST00000156687 5176 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Kif28-203ENSMUST00000221136 3538 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm44037-201ENSMUST00000204816 1891 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm28800-201ENSMUST00000186230 2243 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Lin7a-202ENSMUST00000105280 1634 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm11489-201ENSMUST00000118342 499 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Vpreb1P13372 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms