Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm44131-201ENSMUST00000203036 394 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm44978-201ENSMUST00000206635 317 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 AC140393.4-201ENSMUST00000226994 765 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 4930470P17Rik-201ENSMUST00000062355 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ighv6-3-201ENSMUST00000103486 356 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm22777-201ENSMUST00000104091 129 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gstm1-202ENSMUST00000126593 828 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm15788-202ENSMUST00000140087 751 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm3617-201ENSMUST00000173076 555 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm26241-201ENSMUST00000174944 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm23976-201ENSMUST00000175001 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm22463-201ENSMUST00000175274 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm22547-201ENSMUST00000175281 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm22913-201ENSMUST00000175297 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm23282-201ENSMUST00000175306 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm25972-201ENSMUST00000175374 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm22414-201ENSMUST00000175466 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm26235-201ENSMUST00000175533 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm25084-201ENSMUST00000175556 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm24973-201ENSMUST00000175588 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm23292-201ENSMUST00000175618 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm23646-201ENSMUST00000178119 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm24643-201ENSMUST00000178305 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm24302-201ENSMUST00000178350 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm26386-201ENSMUST00000178407 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm25458-201ENSMUST00000178981 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm22825-201ENSMUST00000179444 101 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Apom-201ENSMUST00000025249 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Mbtd1-206ENSMUST00000107854 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms