Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Grxcr2-201ENSMUST00000097591 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Kif3a-203ENSMUST00000120613 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 1600029O15Rik-202ENSMUST00000179787 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Plekhs1-202ENSMUST00000178590 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Plekhs1-201ENSMUST00000039666 2378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Disp2-203ENSMUST00000110843 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Ercc3-201ENSMUST00000025241 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Dnmt3b-207ENSMUST00000109771 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Mat1a-201ENSMUST00000047286 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Prc1-201ENSMUST00000047558 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Srsf7-201ENSMUST00000063417 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm42765-202ENSMUST00000200017 3131 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Nrf1-202ENSMUST00000069808 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm45871-204ENSMUST00000211710 2003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Cdca2-205ENSMUST00000150006 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Ptk2-209ENSMUST00000226988 4444 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Rbm43-206ENSMUST00000165313 1975 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm12161-201ENSMUST00000121454 361 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm3752-202ENSMUST00000167833 450 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm10128-201ENSMUST00000171360 615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm2956-202ENSMUST00000178722 450 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm10340-202ENSMUST00000188235 615 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm43119-201ENSMUST00000196957 2122 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Cspp1-201ENSMUST00000071087 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Rrn3-201ENSMUST00000023363 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Ezh2-202ENSMUST00000092648 2115 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Btn2a2-202ENSMUST00000110432 2089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Cldn34c1-202ENSMUST00000113348 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Tomm40l-202ENSMUST00000111326 2753 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q8BGC1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms