Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Olfr462-202ENSMUST00000213672 2021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Mbtd1-206ENSMUST00000107854 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Glod4-209ENSMUST00000170710 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 AC125223.2-202ENSMUST00000225020 4103 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm43847-201ENSMUST00000200070 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Defb20-201ENSMUST00000109836 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Olfr1343-ps1-201ENSMUST00000117414 914 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm12538-201ENSMUST00000120064 486 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 1700009J07Rik-201ENSMUST00000178996 912 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm28865-201ENSMUST00000187685 723 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm44341-201ENSMUST00000196168 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Cdk2ap1-205ENSMUST00000196910 483 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 AC125099.1-201ENSMUST00000197780 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 AC125099.2-201ENSMUST00000198228 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm42495-201ENSMUST00000200324 405 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm44749-201ENSMUST00000206285 1628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm34280-201ENSMUST00000208250 2114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm18981-201ENSMUST00000185373 1599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Rab3gap1-207ENSMUST00000212506 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Cacfd1-201ENSMUST00000114003 727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm15729-201ENSMUST00000125829 360 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Mir1964-201ENSMUST00000158514 83 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm10291-201ENSMUST00000094175 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Zfp383-201ENSMUST00000186475 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Zmynd11-202ENSMUST00000110633 1857 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2bQ01097 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm12996-201ENSMUST00000151670 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm2071-201ENSMUST00000193335 774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm10522-201ENSMUST00000194503 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Eif3g-201ENSMUST00000004206 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Morn3-202ENSMUST00000045843 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Fcgr2b-202ENSMUST00000081103 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm16559-201ENSMUST00000160080 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 AC131120.1-201ENSMUST00000217728 1617 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Cntln-203ENSMUST00000107190 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rhag-201ENSMUST00000024721 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Sox2ot-210ENSMUST00000197697 2533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Gm46992-201ENSMUST00000222120 1389 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2bQ01097 Pla2g2d-202ENSMUST00000105806 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms