Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 4933436P19Rik-201ENSMUST00000217736 1442 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Mfsd4a-201ENSMUST00000046658 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm11493-201ENSMUST00000134567 566 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm15351-202ENSMUST00000150686 271 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm3752-202ENSMUST00000167833 450 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm10128-201ENSMUST00000171360 615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm2956-202ENSMUST00000178722 450 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm27383-201ENSMUST00000184418 361 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm10340-202ENSMUST00000188235 615 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm38132-201ENSMUST00000193358 707 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Ighv5-10-201ENSMUST00000194591 252 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Mpv17-204ENSMUST00000200864 878 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm44700-201ENSMUST00000208228 846 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Rab38-202ENSMUST00000208478 579 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Grxcr2-201ENSMUST00000097591 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Birc3-202ENSMUST00000115672 2909 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gpr160-201ENSMUST00000046748 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm13713-201ENSMUST00000139377 703 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm13713-202ENSMUST00000155472 285 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Pcsk2os1-202ENSMUST00000156780 527 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Itgb1P09055 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms