Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Abcc12-205ENSMUST00000152438 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Skap2Q3UND0 Osbpl9-218ENSMUST00000162787 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Klf17-201ENSMUST00000062747 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Ccna1-201ENSMUST00000029368 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Arhgap25-203ENSMUST00000113637 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Itga9-202ENSMUST00000124360 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Olfr320-202ENSMUST00000214662 3029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Rufy3-202ENSMUST00000196686 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Pcdhb4-201ENSMUST00000056712 3718 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Pwp1-201ENSMUST00000001836 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Grm3-201ENSMUST00000004076 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Kif3a-203ENSMUST00000120613 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Ptgs2os2-201ENSMUST00000181308 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Slc7a9-202ENSMUST00000118383 1869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Xpnpep2-202ENSMUST00000114998 3017 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Creb5-201ENSMUST00000047450 2330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Lrrc14b-201ENSMUST00000022064 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Polr3f-202ENSMUST00000110017 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Skap2Q3UND0 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms