Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm32772-203ENSMUST00000207022 675 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Defa-rs1P17533 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Defa-rs1P17533 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Defa-rs1P17533 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Snrp1c-ps1-201ENSMUST00000205464 474 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Defa-rs1P17533 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa-rs1P17533 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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