Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm15448-204ENSMUST00000153846 2145 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Eif4e2-201ENSMUST00000050876 2869 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Sf3b2-201ENSMUST00000025774 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Creb5-201ENSMUST00000047450 2330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Xpnpep2-202ENSMUST00000114998 3017 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Vma21-202ENSMUST00000114576 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm43318-201ENSMUST00000199939 1949 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm10608-201ENSMUST00000093527 2509 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Kdm4a-203ENSMUST00000106403 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Hacl1-214ENSMUST00000167175 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Nr5a2-203ENSMUST00000192357 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Zfp655-202ENSMUST00000167316 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Atg16l1Q8C0J2 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm26782-201ENSMUST00000181482 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ano4-204ENSMUST00000182341 3959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Kcna4-201ENSMUST00000037012 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Ccnc-201ENSMUST00000065928 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gpr85-202ENSMUST00000115491 2165 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 C820005J03Rik-201ENSMUST00000195997 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 1700020I14Rik-202ENSMUST00000153581 8300 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rexo5-203ENSMUST00000106520 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm42575-201ENSMUST00000202942 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg16l1Q8C0J2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms