Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 4930480K15Rik-201ENSMUST00000162121 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atf6F6VAN0 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms