Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 AC153363.1-201ENSMUST00000213572 359 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 AL662807.2-201ENSMUST00000224024 3335 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Lpl-201ENSMUST00000015712 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Ikzf2-207ENSMUST00000190771 2483 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Rint1-201ENSMUST00000030852 3298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 AC168276.1-201ENSMUST00000218963 2385 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Med24-201ENSMUST00000017354 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Wdr6-201ENSMUST00000068700 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Cpm-201ENSMUST00000020399 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gtf2f2-201ENSMUST00000088922 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gigyf2-205ENSMUST00000172794 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Ccdc148-201ENSMUST00000077687 3977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Trpc4-205ENSMUST00000200048 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Fkbp5-202ENSMUST00000114792 3858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 B3gat1-205ENSMUST00000161115 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Prpf6-201ENSMUST00000002529 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Dync1i2-206ENSMUST00000112140 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Vma21-202ENSMUST00000114576 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Pde4b-201ENSMUST00000030251 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gm34776-201ENSMUST00000219415 1140 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 AC160991.1-201ENSMUST00000224924 753 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gm9946-201ENSMUST00000008011 1025 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Kcna4-201ENSMUST00000037012 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Crat-203ENSMUST00000102855 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Grk2-201ENSMUST00000025791 3182 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Ect2l-203ENSMUST00000207827 2730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Cyp2b9-201ENSMUST00000082214 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Derl3Q9D8K3 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms