Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Dsg1bQ7TSF1 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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