Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cox6c-201ENSMUST00000014457 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm11707-201ENSMUST00000150366 490 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm20508-201ENSMUST00000172480 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Ppp1r11-203ENSMUST00000174711 520 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm21965-201ENSMUST00000177770 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm11109-201ENSMUST00000180289 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 B020031M17Rik-202ENSMUST00000180768 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm18822-201ENSMUST00000182857 1025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm9711-201ENSMUST00000208857 327 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 AC154283.2-201ENSMUST00000228954 614 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Rgs9-204ENSMUST00000106706 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Igkv14-130-201ENSMUST00000103307 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Ms4a3-201ENSMUST00000112984 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 BC048671-202ENSMUST00000167550 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Kank3-204ENSMUST00000173789 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 n-R5s210-201ENSMUST00000177688 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm16470-201ENSMUST00000182456 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm27403-201ENSMUST00000184662 214 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm28588-201ENSMUST00000191581 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm18942-201ENSMUST00000213578 1121 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Nt5c1b-211ENSMUST00000218339 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Nt5c1b-201ENSMUST00000002456 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm32284-201ENSMUST00000213704 1484 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm42589-201ENSMUST00000199097 1751 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm15607-201ENSMUST00000119632 358 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm11224-201ENSMUST00000120465 1111 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 4933431E20Rik-205ENSMUST00000137970 795 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm12746-201ENSMUST00000151369 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm12061-201ENSMUST00000151881 479 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Cdk2ap2-203ENSMUST00000174149 386 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Rps10-208ENSMUST00000178774 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Slc35a4-205ENSMUST00000185899 312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm5696-201ENSMUST00000189850 552 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm7434-201ENSMUST00000208558 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Slc25a14-204ENSMUST00000134257 1805 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Akr1cl-206ENSMUST00000162800 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Ccdc38-201ENSMUST00000092215 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm26288-201ENSMUST00000104168 132 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm12966-201ENSMUST00000118024 810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm11518-201ENSMUST00000118048 411 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 1700056N10Rik-201ENSMUST00000141875 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms