Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Zfp131-203ENSMUST00000223722 3109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Lsm6-204ENSMUST00000146824 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Exosc1-201ENSMUST00000075280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Klf17-201ENSMUST00000062747 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Catsperd-201ENSMUST00000112979 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Slc9b2-201ENSMUST00000051849 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 2410002F23Rik-202ENSMUST00000071296 4201 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Fbxw11-202ENSMUST00000093205 3938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 R3hcc1l-201ENSMUST00000026188 4112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbdsP70122 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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