Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ptk2b-201ENSMUST00000022622 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ctns-201ENSMUST00000006103 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 C820005J03Rik-201ENSMUST00000195997 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 AC140393.1-201ENSMUST00000227959 1581 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Armcx5-201ENSMUST00000096321 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Mthfd1-201ENSMUST00000021443 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm15663-201ENSMUST00000145794 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Polr3c-206ENSMUST00000154679 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 G6pc-201ENSMUST00000019469 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Cpm-201ENSMUST00000020399 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Isx-201ENSMUST00000034034 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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H2-Eb1P04230 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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H2-Eb1P04230 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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H2-Eb1P04230 Art2a-ps-201ENSMUST00000173420 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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H2-Eb1P04230 4931431B13Rik-202ENSMUST00000205646 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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H2-Eb1P04230 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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H2-Eb1P04230 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Nsdhl-201ENSMUST00000033715 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm25973-201ENSMUST00000083717 127 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Itpripl1-202ENSMUST00000132773 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm45139-201ENSMUST00000206543 2057 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H2-Eb1P04230 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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